La Universidad de Huelva "está estudiando varias alternativas" para el que fuera  Centro de Interpretación Arqueológica Huelva, Ciudad Milenaria, ubicado en el Cabezo de la Almagra. Así lo indican desde la Onubense. La edificación lleva una década cerrada sin que se le dé ningún uso.

Hace más de un lustro que el Centro de Interpretación Arqueológica Huelva, Ciudad Milenaria está habilitado para uso hostelero, había en proyecto convertirlo en café-cultural. Las obras para reacondicionar la edificación para transformarla en un establecimiento hostelero se llevaron a cabo entre finales de julio de 2016 y enero de 2017 con un presupuesto de 228.024,91 euros.

Una barra de bar ocupa gran parte de la que era la superficie expositiva de la primeraplanta, mientras que el sótano se destina a almacenes y cocina. La intervención no altera la configuración arquitectónica del edificio, diseñado por el arquitecto onubense Sebastián Cerrejón. Se ha construido un patio inglés en su fachada norte, a nivelde sótano, para la maquinaria de climatización y ventilación, y en su fachada sur se ha colocado un umbráculo, junto a los restos arqueológicos.

Un equipo de arqueólogos de la Universidad de Huelva, dirigido por el catedrático de Arqueología Juan Manuel Campos, halló restos arqueológicos en el Cabezo de la Almagra en el año 2002. Estos determinan que hubo una dilatada ocupación en el tiempo en este área de la ciudad debido principalmente a dos factores: su posición estratégica y la disponibilidad de un potencial agrícola con un red hídrica que permitióel mantenimiento de una villa rústica en época romana, una alquería islámica y de un cortijo rural en época moderna-contemporánea.

En el Cabezo de la Almagra se propone un recorrido por la historia a través de los restos arqueológicos, un paseo que comienza por la almazara, un complejo industrial islámico, datado entre los siglos X-XIII d.C., para seguir por los restos de un cortijocontemporáneo (s.XV-XX), la alquería, un complejo habitacional islámico (X-XIII); el lugar donde se encontró un silo romano (I-VI d.C) –la estructura, la más significativadel yacimiento, está cubierta– para finalizar en un complejo habitacional moderno-contemporáneo. La Universidad de Huelva invirtió 12.043 euros en abril de 2019 en la limpieza y restauración de los restos arqueológicos.

El edificio fue inicialmente diseñado como elemento vertebrador de un parque temático sobre la historia de Huelva. Supuso una inversión de 1,5 millones de euros, a cargo de las arcas municipales. En febrero de 2008 el Ayuntamiento de Huelva cedió oficialmente a la Universidad los terrenos del Cabezo de la Almagra y con ello el Centro de Interpretación Arqueológica Huelva, Ciudad Milenaria para su gestión, instalaciones que no abrieron sus puertas hasta el 14 de diciembre de 2011, para cerrarse un año y medio después, concretamente en junio de 2013.

El Centro de Interpretación Arqueológica se cerró para realizarse unas obras de mejora pero la Universidad apostó por modificar su uso y desde entonces permanece cerrado.